マス・フォア・インダストリ研究所

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タンパク質の構造解析へ向けた計算ホモロジーの応用


開催時期 2011-06-14 15:30~2011-06-14 17:00

場所 伊都キャンパス 総合学習プラザ1階 工学部第10講義室

受講対象  

講師 平岡 裕章 (九州大学マス・フォア・インダストリ研究所)

要旨:本講演ではタンパク質の構造解析へ向けた計算ホモロジーの応用に
ついて解説する.タンパク質のファンデルワールス球体モデルはCech複体
によってホモトピー型が決定できることからそのホモロジー群は数値的に
求めることが可能である.またファンデルワールス半径パラメーターが自
然に1次元フィルトレーション構造を定めるが,これによりPersistent
ホモロジー群も取り扱うことが可能となる.本講演ではこれらの基本的な
道具を用いて以下の話題を考察する:
1. 2次ベッチ数とタンパク質の圧縮率の関係
2. Persistent ホモロジー群のタンパク質に普遍的な性質
3. 最小生成元と空洞検出

*九州大学数値解析セミナー・現象数理セミナー 合同セミナーです.
*通常と曜日と場所が異なりますので、ご注意下さい。